Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms