Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmbr1lQ9D1E5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms