Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ms4a6dQ99N07 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms