Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms