Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ube3dQ8BX13 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ube3dQ8BX13 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ube3dQ8BX13 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ube3dQ8BX13 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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