Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acsf3Q3URE1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acsf3Q3URE1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acsf3Q3URE1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acsf3Q3URE1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acsf3Q3URE1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acsf3Q3URE1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acsf3Q3URE1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Acsf3Q3URE1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Acsf3Q3URE1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms