Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
VdrP48281 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VdrP48281 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VdrP48281 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VdrP48281 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VdrP48281 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VdrP48281 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VdrP48281 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
VdrP48281 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VdrP48281 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VdrP48281 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VdrP48281 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
VdrP48281 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VdrP48281 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VdrP48281 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms