Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRIM23P36406 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms