Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tgfb2P27090 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb2P27090 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms