Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms