Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V4

Pck1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pck1Q9Z2V4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pck1Q9Z2V4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pck1Q9Z2V4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pck1Q9Z2V4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pck1Q9Z2V4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pck1Q9Z2V4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pck1Q9Z2V4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pck1Q9Z2V4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pck1Q9Z2V4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pck1Q9Z2V4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pck1Q9Z2V4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pck1Q9Z2V4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pck1Q9Z2V4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pck1Q9Z2V4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pck1Q9Z2V4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pck1Q9Z2V4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pck1Q9Z2V4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms