Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mbd2Q9Z2E1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mbd2Q9Z2E1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms