Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nr1h3Q9Z0Y9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms