Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF8

Tusc2, Tumor suppressor candidate 2, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tusc2Q9WVF8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tusc2Q9WVF8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tusc2Q9WVF8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tusc2Q9WVF8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms