Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubd1Q9R1K7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tubd1Q9R1K7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubd1Q9R1K7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms