Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cpsf3Q9QXK7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf3Q9QXK7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf3Q9QXK7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf3Q9QXK7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf3Q9QXK7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpsf3Q9QXK7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpsf3Q9QXK7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms