Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pkd2l2Q9JLG4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkd2l2Q9JLG4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkd2l2Q9JLG4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms