Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf2ird1Q9JI57 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2ird1Q9JI57 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2ird1Q9JI57 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms