Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pus3Q9JI38 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pus3Q9JI38 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms