Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS9

Cwc15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc15Q9JHS9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cwc15Q9JHS9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cwc15Q9JHS9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cwc15Q9JHS9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms