Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp29Q9ES63 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp29Q9ES63 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp29Q9ES63 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms