Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ube3bQ9ES34 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ube3bQ9ES34 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ube3bQ9ES34 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ube3bQ9ES34 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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