Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfip11Q9ERA6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tfip11Q9ERA6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tfip11Q9ERA6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms