Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQT3

Rhou, Rho-related GTP-binding protein RhoU, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhouQ9EQT3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RhouQ9EQT3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RhouQ9EQT3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms