Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sil1Q9EPK6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sil1Q9EPK6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sil1Q9EPK6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms