Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpr88Q9EPB7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gpr88Q9EPB7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gpr88Q9EPB7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 245.8 ms