Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Riok3Q9DBU3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Riok3Q9DBU3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Riok3Q9DBU3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms