Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR5

1700001F09Rik, RIKEN cDNA 1700001F09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001F09RikQ9DAR5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700001F09RikQ9DAR5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700001F09RikQ9DAR5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms