Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH2

Znrf4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf4Q9DAH2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znrf4Q9DAH2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Znrf4Q9DAH2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf4Q9DAH2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf4Q9DAH2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf4Q9DAH2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf4Q9DAH2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Znrf4Q9DAH2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znrf4Q9DAH2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Znrf4Q9DAH2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Znrf4Q9DAH2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Znrf4Q9DAH2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms