Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmco5aQ9D9D5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmco5aQ9D9D5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmco5aQ9D9D5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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