Protein–RNA interactions for Protein: Q9D991

1700123K08Rik, RIKEN cDNA 1700123K08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123K08RikQ9D991 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700123K08RikQ9D991 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
1700123K08RikQ9D991 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
1700123K08RikQ9D991 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700123K08RikQ9D991 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
1700123K08RikQ9D991 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700123K08RikQ9D991 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700123K08RikQ9D991 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700123K08RikQ9D991 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700123K08RikQ9D991 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700123K08RikQ9D991 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700123K08RikQ9D991 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms