Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lin37Q9D8N6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lin37Q9D8N6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lin37Q9D8N6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms