Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Borcs8Q9D6Y4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Borcs8Q9D6Y4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Borcs8Q9D6Y4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms