Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf3Q9D4H7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lonrf3Q9D4H7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lonrf3Q9D4H7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonrf3Q9D4H7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms