Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smyd3Q9CWR2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smyd3Q9CWR2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smyd3Q9CWR2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms