Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp5f1Q9CQQ7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp5f1Q9CQQ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms