Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab27bQ99P58 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rab27bQ99P58 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rab27bQ99P58 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms