Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tnpo2Q99LG2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnpo2Q99LG2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnpo2Q99LG2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnpo2Q99LG2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms