Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl22Q99JN2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl22Q99JN2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl22Q99JN2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms