Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Sh3bp4Q921I6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Sh3bp4Q921I6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Sh3bp4Q921I6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sh3bp4Q921I6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Sh3bp4Q921I6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Sh3bp4Q921I6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Sh3bp4Q921I6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Sh3bp4Q921I6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sh3bp4Q921I6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Sh3bp4Q921I6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp4Q921I6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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