Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Odf3Q920N1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf3Q920N1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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