Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZM2

Sh2b1, SH2B adapter protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b1Q91ZM2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh2b1Q91ZM2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh2b1Q91ZM2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2b1Q91ZM2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms