Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT8

Smim14, Small integral membrane protein 14, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim14Q91VT8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim14Q91VT8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smim14Q91VT8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim14Q91VT8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms