Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Odf4Q8VI88 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Odf4Q8VI88 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms