Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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Ttc39cQ8VE09 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttc39cQ8VE09 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
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Ttc39cQ8VE09 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Ttc39cQ8VE09 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Ttc39cQ8VE09 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Ttc39cQ8VE09 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Ttc39cQ8VE09 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Ttc39cQ8VE09 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttc39cQ8VE09 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Ttc39cQ8VE09 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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Ttc39cQ8VE09 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ttc39cQ8VE09 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc39cQ8VE09 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc39cQ8VE09 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc39cQ8VE09 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc39cQ8VE09 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttc39cQ8VE09 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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