Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
0610009B22RikQ8R3W2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
0610009B22RikQ8R3W2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
0610009B22RikQ8R3W2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
0610009B22RikQ8R3W2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
0610009B22RikQ8R3W2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
0610009B22RikQ8R3W2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
0610009B22RikQ8R3W2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms