Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nsl1Q8K305 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nsl1Q8K305 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nsl1Q8K305 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms