Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vwc2Q8C8N3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vwc2Q8C8N3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms