Protein–RNA interactions for Protein: Q8C561

Lmbrd2, LMBR1 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd2Q8C561 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmbrd2Q8C561 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmbrd2Q8C561 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmbrd2Q8C561 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmbrd2Q8C561 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms