Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trerf1Q8BXJ2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trerf1Q8BXJ2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trerf1Q8BXJ2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
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